以成为神奇宝贝大师为目标，小智（松本梨香 配音）、小刚（うえだゆうじ 配音）和小光（豊口めぐみ 配音）带着各自的神奇宝贝在世界各地进行艰苦的修业之旅，今天他们历经长途跋涉终于来到了风景秀美的米琪亚镇。在当地一对小兄妹的介绍下，小智一行前往神殿遗址游玩。谁知却遭遇了极其危险的情况。关键时刻，掌管时间的迪亚鲁加和守卫神殿的西娜（北乃きい 配音）、凯宾（岸祐二 配音）帮助了他们，能与神奇宝贝心灵沟通的西娜还熄灭了冥王龙的怒火。从西娜口中得知，创造了世界的神奇宝贝即将苏醒，它不仅会使时空扭曲错乱，还将为世界带来毁灭性的灾难…… 本片为神奇宝贝系列第十二部电影剧场版。
演员：石川界人 赤羽根健治 小野贤章 冈本信彦 野岛健儿 小山力也 川田绅司 真殿光昭 浪川大辅 平田广明 宫本充 浅野真澄 桐本拓哉 森川智之 井上刚 岛田敏 兴梠里美 诸星堇 吉永拓斗 沼田祐介 天神英贵 藤本隆弘 服卷浩司 金本凉辅 佐佐木彩夏 大杉涟 山寺宏一
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演员：古谷彻 铃置洋孝 堀川亮 桥本晃一 堀秀行 潘惠子 绿川光 井上富美子 山本百合子 小山茉美 小野坂昌也 石川英郎 飞田展男 堀内贤雄 日野由利加 森川智之 高桥广树 山路和弘
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